Analyse mit gewichtetem Datensatz

 

Abbildung:   Verteilung der Basen des Plastidendatensatzes 2 auf die 10 Gewichtsgruppen; Gewichtungsfunktion: 1/S; Anzahl Basen: 1393

Anhand des Baumes in Abb. 6.12 wurde ein gewichteter Datensatz mit 10 Gewichten erstellt. Die Verteilung der Basen auf die einzelnen Gewichte ist in Abb. 6.13 dargestellt. Der mit diesem gewichteten Datensatz berechnete Baum hatte einen Log-Likelihood-Wert von -19215,50 (Abb. 6.14). Während der Berechnung des Baumes wurden sechs globale Rearrangements durchgeführt und 28542 Bäume untersucht.

 

Abbildung:   Phylogenetischer Stammbaum der Plastidenentwicklung; konstruiert aus 16S rRNA-Sequenzen (Datensatz plast2 ) in 10 Gewichtsgruppen mittels pfastDNAml; nur Bootstrap-Werte über $60\%$ wurden an den entsprechenden Kanten eingefügt

Es zeigte sich diesmal keine Verschiebung der Cyanellen und Chloroplasten gegeneinander. Um den Bereich dieser Verzweigung näher zu untersuchen, wurde auch hier eine Bootstrap-Analyse mit 100 Bootstrap-Stichproben durchgeführt und die gefundenen Werte in den Baum in Abb. 6.14 eingesetzt.