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Analyse mit allen Sequenzstellen


 
Abbildung:   Phylogenetischer Stammbaum der Aktinentwicklung; berechnet mit pfastDNAml unter Benutzung aller Codon-Positionen
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\epsfig {file=images/figactinfull.eps,height=18.5cm}
\end{figure}

Zur weiteren Betrachtung wurde ebenfalls ein Baum für alle Codon-Positionen (1051 Alignmentspalten, 823 benutzte Spalten) berechnet. Die gefundenen Basenfrequenzen lagen bei 0,244 (A), 0,266 (C), 0,257 (G) und 0,234 (T) und der Transition/Transversions-Parameter bei 1,5048. Nach 11 globalen Rearrangements (je 9120 Bäume) und 108543 ingesamt untersuchten Bäumen wurde ein Baum mit einem Log-Likelihood-Wert von -31275,56 gefunden.



Heiko Schmidt
7/17/1997