Aktinsequenzen

Aus dem vorhandenen Aktin Alignment wurden unterschiedliche Zusammenstellungen von Organismen ausgewählt. Aus dem gesamten Alignment wurden folgende Organismen und Gensequenzen verwendet:

1.

Tiere (Metazoa)

• Aplysia californica
• Bombyx mori A1, A2 (Seidenspinner)
• Drosophila melanogaster (Fruchtfliege)
• Homo sapiens A1, A2, B2 (Mensch)
• Hydra attenuata
• Molgula citrina
• Onchocercus volvulus 1A
• Strongylocentrotus purpuratus (Purpurseeigel)

2.

Pilze

• Absidia glauca
• Cryptococcus neoformans
• Kluyveromyces lactis
• Puccinia graminis
• Saccharomyces cerevisiae (Bierhefe)
• Schizosaccharomyces pombe
• Thermomyces lanuginosis
• Trichoderma reesei

3.

Pflanzen (Landpflanzen)

• Arabidopsis thaliana Ac1
• Daucus carota Ac1, Ac2 (Karotte)
• Oryza sativa Ac1, Ac2, Ac3 (Reis)
• Solanum tuberosum 75, 97, 101 (Kartoffel)
• Glycine max Ac1, Ac3 (Soja)
• Zea mays Ac1 (Mais)

4.

Protista

(a)

Haptophyta (auch Prymnesiophyta)

• Emiliania huxleyi

(b)

Chlorophyta (Grünalgen)

• Chlamydomonas reinhardtii
• Scherffelia dubia
• Volvox carteri

(c)

Glaucocystophyta

• Cyanophora paradoxa

(d)

Rhodophyta (Rotalgen)

• Chondrus crispus
• Cyanidioschyzon merolae

(e)

Heterokontophyta

• Achlya bisexualis
• Costaria costata
• Fucus distichus
• Lagenidium giganteum Ac1, Ac2
• Phytophthora infestans actA, actB
• Phytophthora megasperma
• Pythium irregulare Ac1, Ac2

(f)

Ciliaten

• Euplotes crassus
• Oxytricha fallax
• Tetrahymena thermophila

(g)

andere Protisten

• Acanthamoeba castellanii
• Dictyostelium discoideum
• Entamoeba histolytica
• Naegleria gruberi
• Physarum polycephalum
• Plasmodium falciparum

5.

Außengruppe

• Giardia lamblia (Protozoon ohne Mitochondrien)
• Toxoplasma gondi
• Trypanosoma brucei