Eukaryotische 18S rRNA-Sequenzen

Aus dem vorhandenen 18S rRNA Alignment wurden unterschiedliche Zusammenstellungen von Organismen ausgewählt. Aus dem gesamten Alignment wurden folgende Organismen verwendet:

1.

Tiere (Metazoa)

• Anemonia sulcata
• Artemia salina (Salinenkrebs)

2.

Pilze

• Aethelia bombacina
• Aureobasidium pullulans
• Saccharomyces cerevisiae (Bierhefe)

3.

Pflanzen (Landpflanzen)

• Zamia pumila

4.

Protista

(a)

Ciliata

• Oxytricha nova
• Paramecium tetraurelia (Pantoffeltierchen)

(b)

Heterokontophyta (auch Chrysophyta)

• Achlya bisexualis
• Fucus distichus
• Labyrinthuloides minuta
• Ochromonas danica

(c)

Haptophyta (auch Prymnesiophyta)

• Emiliania huxleyi
• Phaeocystis antarctica
• Phaeocystis globosa

(d)

Rhodophyta (Rotalgen)

• Glaucosphaera vacuolata
• Porphyra umbilicalis
• Porphyridium aerugineum

(e)

Filose Amöben

• Euglypha rotunda
• Paulinella chromatophora

(f)

Chlorarachniophyta

• Chlorarachnion sp. 1
• Chlorarachnion reptans

(g)

Cryptophyta

• Goniomonas truncata
• Guillardia theta
• Rhodomonas mariana
• Rhodomonas salina

(h)

Glaucocystophyta

• Cyanophora paradoxa
• Glaucocystis nostochinearum
• Gloeochaete wittrockiana

(i)

Chlorophyta (Grünalgen)

• Mantoniella squamata
• Staurastrum M752

(j)

Sonstige Protisten

• Acanthamoeba castellanii
• Hartmannella vermiformis
• Prorocentrum micans
• Sarcocystis muris

5.

Außengruppe

• Dictyostelium discoideum