Sammeln eines Datensatzes aus Hanta-Viren
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1) Oeffne: http://srs.ebi.ac.uk
2) Waehle auf der "Library page" die Nukleotid Datenbank "EMBL" aus.
3) Gehe zum "extended query form"
4) Suche alle Dobrava Virus-Sequenzen des M-Segements
   (Tipps: Die Datenbank-Division, die die Virus-Sequenzen enthaelt
   heisst "vrl". Die Laenge des M-Segments ist ca. 3640 Nukleotide,
   die anderen beiden sind ca. 1670 (S-Segment) und 3640 (L-Segment).
5) Speichere die Sequenzen im Format FastaSeqs
6) Suche ebenfalls die M-Segmente Hantaan Virus Typen "84FLi", "Q32" 
   und "A16". 
7) Speichere auch diese beiden in FASTA-Format (FastaSeqs)
8) Kopiere beide Datensaetze in eine Datei und aendere darin die
   Sequenznamen (alles hinter dem '>') zu sinnvollen Namen,
   der <= 10 Buchstaben lang ist, und erkennen laesst, ob die Sequenz 
   von einem Dobrava (DOBV) oder Hantaan Virus (HTNV) und welcher Stamm
   (Strain) das ist.


Generieren eines Alignment
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1) starte das Program "clustalw"
2) Lade mit "Sequence Input From Disc" deine obige FASTA Datei.
2) gehe zu "Multiple Alignments"
3) stelle das Programm so ein das es CLUSTAL format, PHYLIP format
   und NEXUS format als Ausgabe liefert und produzier ein Alignment.
4) Das Alignment kannst Du z.B. mit "seaview" anschauen.
   (starte "seaview", gehe auf: File -> open PHYLIP -> waehle die 
   .phy-Datei aus).

Analyse
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Analysier das Alignment mit Deinen Web-Interface.
Was ist das Ergebnis? Gibt es Einbrueche in der 
Phylogenetischen Information? Wieviel Einfluss hat 
die Wahl der Fenster-Groessen?